《后宫·如懿传》主要讲述了《后宫·甄嬛传》的后续故事：乾隆即位，乾隆后宫嫔妃青樱、高佳·晞月、富察·琅嬅、金玉妍以及魏嬿婉之间的明争暗斗。
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四阿哥弘历登基，后宫权势大变。原本在青樱位分之下的高晞月被封为慧贵妃，而青樱只是被封为娴妃，且住到了偏远的延禧宫。乌拉那拉氏的身份曾经为侧福晋青樱带来无上的荣耀与地位，如今因为景仁宫姑姑废后的原委却让她如芒在背。当日在潜邸时的尊贵、恩宠早已是过眼云烟，种种疑问、委屈只有埋葬在无尽的深宫时光里。
探望过暮年的姑姑之后，为防东窗事发，青樱主动向太后求了新的名字“如懿”，寓意“美好安静”，这才让如懿在宫里的日子稍微好一些。然而，事情并非如她所想的那样，妃嫔们接二连三的滑胎，玫嫔甚至生下一个不男不女的畸形孩子，怡贵人所住的景阳宫突然出现蛇袭击，后转住到娴妃的延禧宫。原来这只是一场阴谋，娴妃的丫头阿箬被慧贵妃和皇后收买，串通外人陷害如懿。龙颜大怒，把如懿打入冷宫...